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浙大专家绘制成功全球首张人类细胞图谱

发布时间:2020-03-26来源:浙江新闻客户端作者: 曾福泉 吴雅兰 柯溢能33

跨越胚胎和成年两个时期、涵盖八大系统、建立70多万个单细胞的转录组数据库、鉴定人体100余种细胞大类和800余种细胞亚类……近日,世界首个人类细胞图谱在浙大绘制成功。北京时间3月26日,国际顶级期刊《自然》在线刊登了澳门新葡新京官方网站学院郭国骥教授团队的这项最新研究成果。

“这项工作概括地说就是人体细胞数字化。我们能清楚地看到每一个细胞的特征,并对它们进行系统性的分类。我们定义了许多之前未知的细胞种类,还发现了一些特殊的表达模式。”郭国骥说。

该研究首次从单细胞水平上全面分析了胚胎和成年时期的人体细胞种类,研究数据将成为探索细胞命运决定机制的资源宝库,研究方法将对人体正常与疾病细胞状态的鉴定带来深远影响。在未来,临床医生可能通过参照正常的细胞状态来鉴别异常的细胞状态和起源。

通过这张图谱,研究团队发现,多种成人的上皮、内皮和基质细胞在组织中似乎扮演着免疫细胞的角色。郭国骥说:“非专职的免疫细胞也在兼职干着免疫的活。我们认为成年人非免疫细胞的广泛免疫激活是人体区域免疫的一种重要调节机制。”

此外,通过跨时期、跨组织和跨物种的细胞图谱分析,团队揭示了一个普适性的哺乳动物细胞命运决定机制:干细胞和祖细胞的转录状态混杂且随机,而分化和成熟细胞的转录状态就变得分明且稳定。也就是说,细胞分化经历了一个从混乱到有序的发展过程。

细胞是生命的基本单位。单细胞测序技术的出现为人类认知细胞的方式带来了革命性的变化。此前,郭国骥团队自主研发了Microwell-seq高通量单细胞分析平台,并于2018年在国际顶级期刊《细胞》上发表了世界首个小鼠细胞图谱。此后,郭国骥团队一直在这个领域精耕细作,并与澳门新葡新京官方网站学院几家附属医院的张丹团队、王伟林团队、陈江华团队、梁廷波团队和黄河团队等保持紧密合作。时隔两年,再出重量级成果。

郭国骥说,Microwell-seq具有成本低廉、双细胞污染率低和细胞普适性广等优势,由此团队建立了70多万个单细胞的转录组数据库,鉴定了人体100余种细胞大类和800余种细胞亚类。同时,团队开发了scHCL单细胞比对系统用于人体细胞类型的识别,并搭建了人类细胞蓝图网站。

郭国骥表示,这项工作在测序深度上存在一定局限性,但是在跨组织和跨物种的数据可比性上有较大优势。完美版的人类细胞图谱还应该整合空间信息、多组学数据和人群分析,这需要全世界科学家的共同努力。


浙江新闻客户端2020年3月26日


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